滇池，亦称昆明湖，位于昆明市西南一带，湖面海拔1886米，面积330平方千米，流域面积2920平方公里，平均水深4.4米，最深处为10米，蓄水量为12.9亿立方米，是云南省最大的淡水湖，有高原明珠之称。滇池风光秀丽，为国家级旅游度假区。

洱海，位于云南大理郊区，为云南省第二大淡水湖，洱海北起洱源，长约42.58公里，湖面面积256.5平方公里，洱海是大理风花雪月四景之一洱海月之所在。据说因形状像一个耳朵而取名为洱海。洱海水质优良，水产资源丰富，同时也是一个有着迤逦风光的风景区。

抚仙湖，位于距昆明52公里的澄江县境内，它是我国最大蓄水量湖泊、最大高原深水湖、第二深淡水湖泊，水域面积约216.6平方千米，最大水深157.3米，平均水深87.0米，在云南省算是第三大湖泊，仅次于滇池和洱海。

程海又称为黑乌海，位于云南省永胜县城以南46公里处，是一个内陆封闭型高原深水湖泊。湖水面积77.2平方千米，海拔1503米，平均水深25.9米，最深36.7，蓄水量19.87亿立方米；南北长20千米，东西平均宽4千米，湖岸线长45.1千米。程海现为封闭型湖泊，程海原由海口河流入金沙江。

泸沽湖为四川云南两省共有，湖岸线四川要比云南的湖岸线长约占2/3。泸沽湖面积50多平方千米，海拔2690米，平均水深45米，最深处达93米，透明度高达11米，最大能见度为12米，湖水清澈蔚蓝，是云南海拔最高的湖泊，也是云南第二深的淡水湖之一。

星云湖是抚仙湖的上游湖泊，通过2.2公里的隔河与抚仙湖相联。湖泊面积34.7平方公里，流域面积386平方公里，平均水深5.91米，最大水深9.5米，蓄水量1.84亿立方米。

杞麓湖，又称通海湖，距离云南省玉溪市通海县城1.5公里，是一个封闭型高原湖泊。湖面海拔1796米，湖泊略呈北东南西向的矩形状，湖泊面积40多平方公里，平均水深4米，最深处约15米，总容量1.5亿立方米。

阳宗海为高原断陷湖泊，湖岸平直，湖底凹凸不平，有岩洞暗礁，水色碧绿，透明度高，为淡水湖，湖内盛产著名的金线鱼。明清时称为明湖，湖面形如一只巨履，两头宽，中部略窄，海拔1770米，南北长约12公里，东西宽约3公里.湖面积30平方公里，平均水深22米，最深30米。

异龙湖是云南九个湖泊中最小的湖泊，位于石屏县城以东两公里处。湖泊面积30.63平方公里，流域面积360.4平方公里，平均水深2.75米，最大水深6.55米，蓄水量1.13亿立方米。